Στο Γυμνάσιο Παναιτωλίου υλοποιείται από τον Σεπτέμβριο 2012 έως τον Ιούνιο 2014 Ευρωπαϊκό Πρόγραμμα Δια Βίου Μάθησης Comenius (Πολυμερής Σύμπραξη σχολείων), το οποίο χρηματοδοτείται από το Ίδρυμα Κρατικών Υποτροφιών (Ι.Κ.Υ.). Συμμετέχουν οκτώ σχολεία από διαφορετικές ευρωπαϊκές χώρες με θέμα την ορθολογική διαχείριση του νερού, «TodayBluePlanet, ButTomorrow?». Στο πλαίσιο των εργασιών του προγράμματος πραγματοποιήθηκε από 14 έως 19 Νοεμβρίου 2012 η πρώτη επίσκεψη στο συντονιστικό σχολείο, «KumburgazIlköğretimOkulu», στην πόλη Kumburgaz, στην ευρύτερη περιοχή της Κωνσταντινούπολης στην Τουρκία. Στην συνάντηση, λόγω του οργανωτικού χαρακτήρα της, συμμετείχαν μόνο καθηγητές. Συγκεκριμένα μετακινήθηκαν 17 άτομα από Γαλλία, Ελλάδα, Ιταλία, Ουγγαρία, Πολωνία, Πορτογαλία, Ισπανία προς Τουρκία. Στην ελληνική αποστολή συμμετείχαν η Θεοδώρα Μαργάρα, Διευθύντρια του Σχολείου και η Μαίρη Λανοπούλου, Υπεύθυνη του Προγράμματος.