Αναλυτικά οι όμιλοι:
1ος όμιλος:
Ατρόμητος, ΠΑΣ Γιάννινα, Ηρακλής, Θύελλα Καμαρίου
2ος όμιλος:
ΑΕΚ, Λαμία, Απόλλων Λάρισας, Βόλος
3ος όμιλος:
Παναιτωλικός, Παναθηναϊκός, Κισσαμικός, ΟΦ Ιεράπετρας
4ος όμιλος:
ΠΑΟΚ, Άρης, Εργοτέλης, Αήττητος Σπάτων
5ος όμιλος:
Ολυμπιακός, Λεβαδειακός, Παναχαϊκή, Άρης Αβάτου
6ος όμιλος:
Αστέρας Τρίπολης, Απόλλων Σμύρνης, Τρίκαλα, Απόλλων Παραλιμνίου
7ος όμιλος:
Ξάνθη, ΟΦΗ, Κασσιόπη, Νίκη Βόλου
8ος όμιλος:
Πανιώνιος, Λάρισα, Απόλλων Πόντου, Ηρόδοτος
Υπενθυμίζεται πως από κάθε όμιλο προκρίνονται οι δυο πρώτοι, ενώ προβλέπονται τρεις αγωνιστικές. Εξάλλου, το σύστημα διεξαγωγής των αγώνων της φάσης των ομίλων διασφαλίζει ρητώς ότι οι ομάδες της Super League θα δώσουν δύο αγώνες εκτός έδρας και έναν εντός έδρας, και οι υπόλοιπες ομάδες θα δώσουν δύο αγώνες εντός έδρας και έναν αγώνα εκτός έδρας, με τον εξής κλειδάριθμο:
Το πρόγραμμα της φάσης των ομίλων:
1η Αγωνιστική: 25-26-27/9/2018
2η Αγωνιστική: 30-31/10/2018 και 01/11/2018
3η Αγωνιστική: 4-5-6/12/2018
3ος όμιλος
1η αγωνιστική
Παναιτωλικός-Παναθηναϊκός
Ιεράπετρα-Κισσαμικός
2η αγωνιστική
Κισσαμικός-Παναιτωλικός
Παναθηναϊκός-Ιεράπετρα
3η αγωνιστική
Κισσαμικός-Παναθηναϊκός
Ιεράπετρα-Παναιτωλικός